نام این مدرسه 4 ایوانی سلطانی است زیرا در زمان شاه سلطان حسین ساخته شده است و به دلیل قرار گرفتن در جاده چهارباغ به آن مدرسه چهارباغ می گویند. علت اینکه آن را مدرسه مدرسه نیز می نامند به این دلیل است که مادر شاه سلطان حسین چندین کاروانسرا، بازار و سایر مؤسسات اقتصادی را در آنجا وقف کرده است.
در بقیه نذرها، مدرسه را «مدرسه سلطانی» و در گذشته «مدرسه سلطان حسینیه» نامیده اند. نام مادر سلطان حسین ذکر شده است، هرچند نه در تقدیم نامه فوق الذکر و نه در کتیبه های متعدد ساختمان مدرسه. اگرچه او نیامد، اما این مکان به نام مدروشه نامگذاری شد، زیرا مادروشاه دو ساختمان خود را در مجاورت مدرسه، یعنی سرایفتیه و بازارشاهی (یا بازار طویل) به مدرسه چهارباغ و شاگردانش وقف کرد. مدرسه او نیز نامیده می شود. مدرسه ای که در خیابان چهارباغ قرار دارد، چهارباغ نام دارد.
بنا به گفته خاتون آبادی، ساخت مدرسه را او در سال ۱۱۱۶ آغاز کرد و تقریباً در سال ۱۱۱۸ به پایان رسید، هرچند تاریخ کتیبه‌های مدرسه متفاوت است. کتیبه ای عمودی در داخل گنبد به سال 1104 و کتیبه ای بیرون گنبد مربوط به سال 1122 است. در سال های 1123 و 1124 بسیاری از وقف نامه های مدرسه نیز به خوبی چیده شده است. به طور کلی ساختمان اصلی مدرسه در سال 1119 به پایان رسید. در سال 1118 ذی حجه به آن افزوده شد و سلطان حسین محمد وکیر هاتون آبادی را برگزید. به عنوان مدرسه ای از مدارس، اما افتتاح رسمی مدارس و شروع آموزش چندین سال به تعویق افتاد.
مدرسه سلطانی در روز جمعه دهم رجب سال 1122 با حضور شاه، علما، اشراف و شخصیت های برجسته به طور رسمی افتتاح شد. خاتون آبادی شرح مفصلی از این مراسم باشکوه ارائه کرد و گردهمایی مراسم افتتاحیه را در حکومت صفویه بی سابقه دانست. اتاق مدرسه این جلسه با تایید معلم مدرسه بین دانش آموزان تقسیم شد.
سلطان حسین همچنین از هاتون آبادی خواست که اولین درس را به عنوان معلم مدرسه شروع کند، اما از او خواست که اولین درس را برای تکریم و احترام به مقام علمی آقا جمال الدین کانساری تدریس کند. و بعدها خودش چندین کتاب در فقه و اصول تدریس کرد.

فهرست مطالب
تاریخچه مدرسه چهار باغ اصفهان
موقعیت مدرسه چهار باغ اصفهان
نام های مدرسه ی چهارباغ اصفهان
مساحت مدرسه چهار باغ اصفهان
دلایل نام گذاری مدرسه چهار باغ اصفهان
ویژگی بنا مدرسه چهار باغ اصفهان
ویژگی سردر مدرسه چهار باغ اصفهان
سر در ساختمان ورودی مدرسه چهار باغ اصفهان
بررسی نما مدرسه چهار باغ اصفهان
سبک بنا مدرسه چهار باغ اصفهان
ویژگی سبک اصفهانی مدرسه چهار باغ اصفهان
بررسی ایوان و حجره ها مدرسه چهار باغ اصفهان
ورودی مدرسه چهار باغ اصفهان
پی سازی مدرسه- مسجد
سنگاب های مدرسه چهارباغ
ویژگی طراحی بنا
پلان مدرسه چهار باغ اصفهان
اساتید بزرگ مدرسه چهارباغ
کتابخانه ی مدرسه ی چهارباغ
کاربری های دیگر مدرسه تاریخی چهار باغ
ویژگی بنا مدرسه چهار باغ اصفهان
ویژگی گنبد مدرسه چهار باغ اصفهان
نقوش هندسی مدرسه چهار باغ اصفهان
بررسی کتیبه ها مدرسه چهار باغ اصفهان
کتیبه های مضامین مدرسه چهار باغ اصفهان
کتیبه قرآنی مدرسه چهار باغ اصفهان
احادیت  در کتیبه ها
سرنوشت مدرسه ی چهارباغ
مقطع مدرسه چهار باغ اصفهان
نما مدرسه چهار باغ اصفهان
پلان مدرسه چهار باغ اصفهان
و…